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科技服务 全基因组重测序
基因组水平-全基因组重测序

The genomic signature of dog domestication reveals adaptation to a starch-rich diet.

Nature, 495, 360–364 (21 March 2013).

 

为了研究狗的驯化进程,对多个品系的狼和狗进行全基因组重测序并发现380万个SNP位点。进一步研究发现了36组促使狗进化(区别于狼)的基因,其中在脑部基因中有8组是参与神经系统发育的,这些基因使得狗更加温顺,从而解释了狗如何过渡成为人类的好朋友。此外还发现10个与淀粉消化脂肪代谢密切相关的基因在狗中显著高表达,使得狗饮食结构与狼产生差异。

 

研究方法

 

 

结果分析

 

将snp的杂合度较低和FST较高的区域定义为驯化候选区域CDR,功能分析表明与神经发育密切相关。

 

淀粉酶相关基因的拷贝数 ,表达量,酶活性在狗和狼中都存在显著差异。

 

参考文献

 

[1] Govindan R, Ding L, Griffith M,et al.Genomic landscape of non-small cell lung cancer in smokers and never-smokers. Cell, 2012, 150:1121-34.

[2] Murchison EP, SchulzTrieglaff OB, Ning Z,et al. Genome sequencing and analysis of the Tasmanian devil and its transmissible cancer. Cell, 2012, 148:780-791.

[3] Axelsson E, Ratnakumar A, Arendt ML et al.The genomic signature of dog domestication reveals adaptation to a starch-rich diet.Nature 495, 360–364 (21 March 2013).

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