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科技服务 Human靶向甲基化测序
表观遗传学研究服务-Human靶向甲基化测序

DNA甲基化对生命活动非常重要,是基因调控的手段之一(即,通过对位于启动子及第一外显子区的CpG岛的甲基化而抑制基因的表达),它在维持细胞正常功能、传递基因组印记、胚胎发育、肿瘤发生等方面起着至关重要的作用,更是表观遗传学研究的热点。

对于DNA甲基化的检测,根据不同应用,采用靶向测序的方法-先设计探针,定向捕获目标序列,再用Bisulfite处理并结合第二代高通量测序,对捕获的DNA片段进行测序,从而有针对性的定量检测目标序列的甲基化位点。

 

产品优势

 

安捷伦SureSelect靶向序列捕获试剂盒优势

• 探针设计:cRNA探针长度>120bp,更有效捕获变异序列,比DNA探针更有效捕获DNA目标序列;仅需24小时杂交,3 μg起始量gDNA,将PCR所需循环数降至最低。

• 检测精度高:单碱基分辨率,精确分析每一个C碱基的甲基化状态。

• 效率高,耗时少:借助新一代高通量测序平台可检测除CpG岛外的shore and shelf ±4kb的范围区域,稳定可靠的液相靶向捕获测序技术。

 

罗氏SeqCap Epi甲基化富集试剂盒技术优势:

• 实验流程:先重亚硫酸盐处理后捕获,捕获后多样性高,重复性好。

• 探针生产:针对区段各种甲基化情况独立设计的探针确保所有甲基化位点的有效捕获。

• 双链捕获:与单链捕获相比双链捕获能提供多态性信息,提高甲基化分析的正确性。

• 定制设计:更关注于感兴趣的区域(DMR),或者非人类的甲基化,更多收获需要更少的样本起始量,低至1ug。

 

捕获试剂盒产品规格:

 

1. 目录产品

 
SureSelectXT Human Methyl-Seq(84M 区域)
捕获的区域通常包括CpG岛,Ensemble数据库中的调控元件,癌症组织特异的DMRs,ENCODE promoters,DNAsel超敏感位点,参考基因等。
SeqCap Epi CpGiant(80.5M区域)
包含了Illumina Infinium Human Mthylation 450K的所有甲基化位点及其附近的区域,覆盖了人类基因组上大于5.5 million个CpG位点。
 
2. 定制产品
 
安捷伦定制甲基化捕获区域分别有:(16个样本起订)1k-499k、0.5M-2.9M、3M-5.9M、6M-11.9M、 12M-24M
罗氏定制甲基化捕获区域有:
SeqCap Epi Choice Enrichment Kits(人类特定基因组定制设计):小区域( <30M),中等区域(30-60M),大区域(60-90M);包装数:4,48,384
SeqCap Epi Developer Enrichment Kits(非人特定基因组定制以及超大区域的人类基因组):小区域( <30M),中等区域(30-60M),大区域(60-90M),超大区域(90-210M);包装数:12,48,384
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