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科技服务 新物种均一化cDNA文库测序
转录组层次研究服务-新物种均一化cDNA文库测序

均一化cDNA文库是指某一特定组织或细胞的所有表达基因均包含其中,且在cDNA文库中表达基因对应的cDNA的拷贝数相等或接近。构建均一化的cDNA文库的主流方法是基于基因组DNA在拷贝数上具有相对均一化的性质,通过cDNA与基因组DNA饱和杂交而降低在文库中高拷贝存在的cDNA的丰度;均一化处理后文库的高丰度表达 cDNA 是处理前的0.3%~2.5%,基本满足节约筛选的要求。

 

均一化cDNA文库具有以下4方面的优点:

1) 在经济上具有广泛的应用空间,可以节约大量试验成本。

2) 增加克隆低丰度mRNA的机会,适用于分析各种发育阶段或各种组织的基因表达及突变检测。

3) 与原始丰度的mRNA拷贝数相对应的cDNA探针与均一化的cDNA文库作杂交,可以估计出大多数基因的表达水平及发现一些组织特异的基因。而以往的文库构建,忽略了mRNA丰度的影响。

4) 可以用于遗传图谱的制作和进行大规模的原位杂交,作为优化的文库系统还可以用于大规模的测序或芯片制作等研究。

技术优势:
 
1. 完整性好:均一化测序可以得到大量低丰度转录本,获得的转录本信息更加完善;
2. 延续性高:获得的完善转录本信息有利于做更多后续研究;

 

3. 可靠性强:高数据量保证不同丰度的转录本都能准确鉴定。
 
技术优势
 
1) 完整性好:均一化测序可以得到大量低丰度转录本,获得的转录本信息更加完善;
2) 延续性高:获得的完善转录本信息有利于做更多后续研究;
3) 可靠性强:高数据量保证不同丰度的转录本都能准确鉴定。
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