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10x官方技术专家莅临晶能生物培训10x单细胞V(D)J测序
发布日期:2018-03-12浏览:
10x Genomics在既有的Illumina的HiSeq测序平台上,突破以往短片段测序在基因体组装及分析上的局限,能提供更为经济但同样完整的高质量基因体组装结果。其独特GemCode™油滴微珠技术将转录体定序的分辨率提升到单一细胞的层次,实现真正的Single cell RNA sequencing。对于免疫细胞,利用特殊Primer设计,更是能够全面解析每一颗免疫细胞全长V(D)J序列组合 (Single Cell V(D)J Solution)。
 
3月5日-6日,10x官方技术专家Joe来我司做了关于10x V(D)J培训,包括理论知识与实验操作两方面。
 
Day 1
overview of Chromiumnn SC System
Platform Technique Training 
Cell preparation and run setup 
Set up RT with overnight hold 
 Prep Day 2 
 
Day 2
 Review, prep lab for recovery 
GEM recovery and clean-up 
5'eDNA Amp or enrichment PCR 
Clean up and QC 
Software Overview
 
 
 
10x V(D)J测序的应用

1. 抗体的鉴定和新抗体的发现

2. 揭示Ig库的发展,绘制全局Ig库

3. 研究传染性疾病,如感染发展中的抗体进化谱系等

4. 研究免疫失调疾病的V(D)J重组倾向性,寻找免疫失调疾病的标记物

5. 癌症早期检测以及癌症进程和复发诊断的标记物

 
10x V(D)J测序优势

1. 一次测序可同时上8个样本,每个样本可以捕获几千个细胞

2. 相对于其他平台,单细胞测序的成本较低

3. 无需分选细胞,就可实现单细胞测序

4. 更小的测序偏好性:不使用V-或J-特异性引物,避免多重PCR的偏好性

                                    UMI序列进一步降低偏好性,并能够对转录本进行定量

5. 更多的发现:可检测整个V(D)J区段的生殖系和体细胞突变

                         可检测各种重组事件

                         可检测每个细胞中多种TCR α基因的表达情况

                         可覆盖转录起始位点

6. 为其他转录本的细胞分型和表型分析提供可能。

 
晶能生物即将推出10x V(D)J测序服务,敬请期待。
coming soon ...
 
晶能生物现已推出10x单细胞转录组测序服务。
我司具备丰富的10x单细胞转录组建库经验,已与国内多家单位合作(中科院神经所/生化所、瑞金医院、浙江大学等),成功处理过多种细胞(外周血单核细胞、神经细胞、肿瘤细胞、骨髓细胞、胚胎细胞、免疫细胞、干细胞),提供带仪器上门建库服务,欢迎垂询!
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